黃柏與黃連同樣含較多的小檗堿，故其藥理作用亦大體相似。但含量較黃連低，并含有其他成分，作用亦有些差異。那么，黃柏有什么副作用呢?

1、服用禁忌

《本草經疏》中記載：“陰陽兩虛之人，病兼脾胃薄弱，飲食少進及食不消，或兼泄瀉，或惡冷物及好熱食;腎虛天明作泄;上熱下寒，小便不禁;少腹冷痛，子宮寒;血虛不孕，陽虛發熱，瘀血停滯，產后血虛發熱，金瘡發熱;癰疽潰后發熱，傷食發熱，陰虛小水不利，痘后脾虛小水不利，血虛不得眠，血虛煩躁，脾陰不足作泄等證，法咸忌之?！?/p>

因此，脾虛泄瀉，胃弱食少者忌服。

2、毒副作用

黃柏具有輕微毒性，黃柏堿和昔羅匹林對中樞神經系統有抑制作用，小鼠的自發活動、各種反射均受到抑制;給予未麻醉家兔昔羅匹林，腦電波可出現振幅慢波。黃柏堿有輕度的箭毒樣作用，對蛙腹直肌緊張度無影響，但能抑制由乙酰膽堿引起的收縮反應。

此外，黃柏所致過敏性藥疹：曾有1例患者用開水沖服黃柏1錢左右，于服藥5-6小時后，胸部發癢，繼起多個小疙瘩，并蔓延全身，經脫敏常規治療而愈。事后再用黃柏煎液行皮膚劃痕試驗，呈強陽性反應。

對于黃柏毒性的研究：黃柏流浸膏腹腔注射，對小鼠的半數致死量為2.7g/kg。黃柏堿腹腔注射對小鼠的半數致死量為69.5mg/kg。黃柏果揮發油灌胃對小鼠的半數致死量為6.683±0.656g/kg。