傳說在四川大巴山深處，有一個青年幫助老中醫照料藥園。一年冬天，他在后山坡偶然發現一朵黃綠色的小花，迎著凜冽的寒風獨自開放。他好奇地把它連根挖出，移栽在藥園子里。從此他經常澆水施肥，這株綠色的花草長得枝葉繁茂。一天，老醫生有個名字叫桂花的女兒得了急病，發冷、發燒、大便帶膿血、便次增多，僅僅兩三天就神志不清了。這時老醫生外出行醫未歸，小伙子十分焦急。他突然想起有一次喉嚨痛，摘下園里那棵小花的一兩片葉子嚼了嚼，喉嚨竟不痛了。他急忙從園子里拔了一棵，熬水送給桂花喝了，桂花的病漸漸好起來。老醫生回來后連聲稱贊說：“看來這黃綠花的小草對清熱燥濕解毒真有特效!”這位青年姓黃名連，后人為了紀念他，便把這小草定名為黃連。

黃連別名玉連、支連，為毛茛多年生草本植物黃連的根莖，主產四川、湖北等地。秋季采挖，去須根及泥土，曬干，生用，酒炒、姜汁炒、吳茱萸水炒用，用時搗碎。黃連味苦性寒，歸心、胃、肝、膽、大腸經。具清熱燥濕，清心除煩，瀉火解毒之功效。

中醫常用黃連配合其他藥物治療一些疾病，比如，因心胃火熱引起的心下痞滿、脘腹熱痛、口舌生瘡、目赤牙痛、便秘尿赤;因血分熱毒郁積而致的瘡瘍癤腫;因溫病熱邪入心而致的神昏譫語、煩躁不寧、汗出口渴、身熱舌紅、心煩失眠等諸癥。

黃連還有清肝明目的作用。中成藥黃連羊肝丸主治肝經火盛、血虛不榮導致兩目昏、視物不清、羞明怕日、雀目夜盲、胬肉攀睛等癥。用黃連煎水，外用洗目，可治目赤目痛、火眼暴發。

黃連燥濕止痢功效明顯。因濕熱食滯而致的痢疾，常以黃連配木香、白芍、當歸、檳榔、黃芩、白頭翁、茯苓、厚樸、枳實同用。治療口腔炎、尿路感染常用黃連9克，生地15克、竹葉9克，木通、甘草各6克，水煎服。治萎縮性鼻炎可用黃連3克，煎汁一酒杯，大蒜頭一瓣搗爛，混合攪汁，滴鼻，每日3?觸5次。治滴蟲性陰道炎可用黃連18克，煎水1000毫升，用吸膿球或注射器吸取黃連水沖洗陰道，每日1次。

使用黃連應注意不可過量，否則會造成“苦寒傷胃”的不良反應如消化不良、食欲減退、惡心嘔吐等。黃連性燥，多用易傷津液，宜與養陰藥同用。凡脾胃虛寒非有濕熱實火者請慎用。

現代研究發現，黃連的有效成分黃連素(小蘗堿)具有廣譜抗菌作用，對痢疾桿菌的抑制作用最強，優于磺胺類藥物。