達爾文與表姐�，斚鄳�，1839年1月兩人結婚，婚后生了10個兒女。長子威廉(1839年生)無生育能力；次子喬治(1845年生)有神經質，愛談論他人病痛；三子費朗西斯(1848年生)患精神憂郁癥；四子倫納德(1850年生)無生育能力；五子雷勒斯(1851年生)多病，一直處在母親照料之下；六子小查理(1856年生)2歲時死亡；長女安妮(1841年生)10歲時患猩紅熱而死；次女瑪麗(1842年生)出生后即死；三女亨利埃塔(1843年生)，無生育能力；四女伊莉沙白(1847年生)終身未嫁。直到晚年，達爾文才悟出這種不幸的原因。他以極大的努力進行了植物受精的研究。實驗證明，植物的高度的生命力，異花受精比自花受精優越。他從這一發現中受到了啟示；他和埃瑪所生子女體弱多病，正是近親婚配造成的惡果。