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現在自閉癥的小兒發現得越來越多，但是引起小兒自閉癥的原因，目前通過各種各方面的研究，實際上還不能完全確定，可能和很多因素有關。1、染色體變化：可能和小兒的染色體變化有關系，比如有脆性X染色體陽性的人，由于染色體異常，自閉癥的發生率會比較高；2、基因變化：通過各種分子遺傳學的研究發現，自閉癥本身是一個多基因遺傳的狀態，所以自閉癥可能和多種基因的變化有關系。研究發現很多和自閉癥相關的易感基因，包括像2號、7號、15號染色體長臂的異常可能都有關系。所以自閉癥的發生，可能和小兒多種基因的異常有關；3、圍產期因素：還可能和圍產期的一些因素有關，比如父母高齡、媽媽的產次比較多，還有小兒出生時早產，或者有圍產期的缺氧，小兒有窒息、宮內窘迫等，或者出生體重比較小等，這些因素都可能會導致小兒自閉癥的發生。此外，自閉癥的小兒的神經系統結構可能也有問題，研究也會發現自閉癥小兒的各個腦區的連接比正常人差，所以神經細胞功能可能也會受影響。另外，可能還有一些心理因素。所以自閉癥的發生可能原因多種多樣，目前還不能完全確認。