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胃腸道間質瘤在治療過程中，應注意以下幾個方面：1、基因檢測：胃腸道間質瘤是由KIT和PDGFRα這兩個基因驅動導致的一類疾病，基因檢測的具體突變位點可以指導用藥，而且與藥物的療效相關，如大多數的KIT或PDGFRα基因突變的胃腸道間質瘤，一線的伊馬替尼敏感，選擇伊馬替尼進行新輔助治療或者輔助治療可以獲益。但是在KIT或PDGFRα未發生突變的情況下，此時伊馬替尼可能不能夠帶來臨床獲益，需要進一步明確突變的情況，選擇最佳的治療方案；2、影像學檢查：影像學檢查的頻率隨著治療階段的不同有所改變，在治療初期，為了驗證藥物的療效，檢查的頻率要高，一般2-3個月一次。在疾病穩定之后，可以半年左右復查一次，規律的影像學檢查可以幫助患者及時發現耐藥的發生，及時發現新的病灶，及時進行有效處理；3、不良反應的管理：患者在藥物治療過程中往往會發生不良反應，包括水腫、惡心、嘔吐、皮疹、乏力、腹瀉等，有些不良反應可逆，可以控制，但是嚴重的不良反應，可能會導致患者不能夠耐受，可能會導致治療中斷，甚至危及生命，因此治療過程中出現不良反應，要及時聯系主治醫師，進行及時處理。