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肺部真菌病常見的確診方法如下：1、細菌學診斷：指從肺部取出的標本或痰中，可以直接培養出致病菌或肺部標本、痰標本的涂片中可以發現菌絲、孢子，兩種方式都可以對肺部真菌病進行確診；2、病理學診斷：指通過氣管鏡或經皮肺穿刺取出的肺內標本后，將其做成病理切片，可以觀察到真菌感染比較明顯特征或可以觀察到菌絲，也可以確診為肺部真菌病；3、逆診：通過患者的胸片、CT等影像學診斷，根據醫生的臨床經驗可能是真菌感染且臨床癥狀與真菌感染的癥狀相似，此時通過做G試驗、GM試驗和痰涂片培養，有一項符合肺部真菌病的診斷標準，也可以確診為肺部真菌病；4、其他診斷：如果以上診斷無法確診，可以通過咳出的痰培養出的真菌或咳出的痰，經過涂片發現有孢子和菌絲。同時GM試驗是陽性或IgG真菌的抗體強陽性，也可以診斷為肺部真菌病，但屬于間接的診斷。