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引起肺部感染的病原菌常見細菌、非典型病原體、病毒、真菌。相對而言，肺部真菌感染的治療最棘手，主要從兩個方面分析： 1、往往發生肺部真菌感染的患者都存在基礎疾病，引起肺部真菌感染常見的病原菌是曲霉菌、念珠菌和隱球菌，屬于條件致病菌，也叫機會性真菌。病原性比較弱，在人體健康或者正常情況下不致病，只有在抵抗力下降的情況下才會致病。易感人群包括肺結核、糖尿病、艾滋病、腫瘤、長期服用糖皮質激素和免疫抑制劑的患者，還有營養不良嚴重燒傷的患者。由于基礎疾病存在，使肺部抗真菌治療難度明顯增加； 2、由于抗真菌藥物往往比較貴，副作用相對比較大，療程比較長，使患者很難堅持下來。 但是，肺部真菌感染并不是一種絕癥，很多患者經過積極治療，病情可以得到控制；肺部真菌的治療首先要控制患者原發病，提高免疫力，同時通過檢查明確真菌的種類和藥敏，選擇針對性抗真菌治療，必要的時候采用手術或者介入等手段進行治療。