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頭部CT和磁共振設備不一樣，CT和磁共振都能檢查頭部及身體其它部位，但是對于頭部來講，CT觀察內容沒有磁共振精細。一般情況下，急診、顱骨病變，建議做CT，比如外傷、腦血管、感染性病變。磁共振軟組織分辨率高，比如白質病變、發育性病變、早期中風，CT大概在24-48小時才能看到病變，但磁共振特殊檢查，即平時用的DWI系列，可以在半個小時看到梗死部位、梗死范圍。 所以對于頭部來講，常規情況可以用CT，但是大部分情況下，神經系統進行磁共振檢查的優勢更明顯，另外磁共振沒有輻射，對磁共振頭部應用現在越來越多。