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磁共振的檢查時間長，CT掃描速度快。一般磁共振做一個部位，至少要十分鐘左右，加上上床準備的時間可能需要20分鐘左右； CT時間較短，因為CT掃描速度快，平掃幾秒鐘就掃描完了，這是磁共振和CT主要的區別。但是一些復雜的可能相對就不一樣，比如CT做冠狀動脈成像要做增強和準備，可能時間就相對長，但是跟磁共振來比較，時間還是較短。 不同器官的檢查需要不同的準備，比如做磁共振，患者做腹部前有時需要先做盆腔的檢查，有時需要憋尿。做上腹部的檢查一般都是要禁食、少吃一些，主要怕患者做增強磁共振時出現嘔吐的情況，CT也是一樣。