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肺穿刺手術的適應癥主要是針對肺部疾病不能明確診斷，需要通過肺穿刺取病理活檢的疾病，如肺外周結節＞2cm，都可以進行肺穿刺。現在大部分肺穿刺都在CT定位下進行，肺穿刺結節已經在逐步縮小，更小的小結節也能夠通過肺穿刺。另外肺穿刺也可以在模擬機下進行定位穿刺。模擬機就是在做CT檢查時，模擬針進刺到一個部位，針在這個部位的時候，再進行一次CT檢查，看針穿刺位置是否和所要穿取的位置一樣，能夠更加準確的取到病理活檢組織。肺穿刺的適應癥還有肺部疾病，不能明確診斷，但是病灶范圍比較廣泛，如特發性肺間質纖維化。由于醫學的發展，對診斷要求已經有明顯的提高，不再滿足于以前的胸片、CT來判斷。所以現在診斷疾病，特別是疑難或者治療之后效果不好，很多情況下都需要進行肺穿刺活檢。