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細菌性感染和病毒性感染都是臨床上感染性疾病非常常見的類型，甚至有些醫生都不是能夠很好的區分細菌性感染和病毒性感染，但是區分這兩種疾病又極其重要，因為細菌性感染往往用抗菌素治療，病毒性感染不用抗菌素治療，如果不應該用抗菌素，用大量抗菌素會導致抗菌素耐藥，所以區別細菌性感染和病毒性感染很重要。 細菌的感染部位比較明確，而且主要在感染地方引起疾病損害，比如呼吸系統感染引起細菌性肺炎，主要是咳嗽、咳痰，主要是引起肺部感染，其它系統很少受累。泌尿系統感染會出現尿疼、尿急、尿頻、尿里有大量白細胞、細菌，往往是細菌感染。病毒性感染，比如臨床常見的上呼吸道感染，像感冒、流感、普通腹瀉，多數都是病毒感染，系統可能不是很清楚，比如病人又發燒，又可能會出現拉肚子，還有可能會出現咳嗽，感染系統可能不像細菌局限性。