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胃鏡病理檢查是胃鏡檢查重要內容，可以通過病理檢用福爾馬林固定，石蠟包埋以后切片染色，放于顯微鏡下觀察。可以看細胞形態是否有萎縮，有無惡性腫瘤、腸上皮化生、不典型增生、中性粒細胞浸潤或嗜酸性粒細胞浸潤，可進一步彌補肉眼不能觀察到的景象。標本在內鏡下觀察，可觀察有無黏膜增生物、潰瘍、腫瘤、紅斑、糜爛、出血等。但并不能看到黏膜內，要看黏膜內部情況需進行病理組織檢查，屬于臨床常用到病理檢查手段。胃鏡檢查后病理報告可以準確告知，屬于慢性淺表性胃炎或慢性萎縮性胃炎，手否存在腸上皮化生、不典型增生、癌變等。