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胃鏡病理檢查主要目的是區分病變性質，一般做胃鏡后，臨床醫生會告訴胃鏡報告是什么樣的，但是臨床醫生如果在胃鏡下看到胃里長了一個凸起的東西，臨床醫生只是看到東西是凸起的，它的表面是什么情況，這個病實質上是什么東西，無法判斷。通過做胃鏡病理檢查，把這個東西取出來送到病理科，病理科做成病理切片，病理醫生在鏡下做診斷，凸起的東西可能是良性病變，即胃息肉；也有可能是惡性的，像淋巴瘤、胃癌或者胃的神經內分泌腫瘤，這些具體的診斷都是由病理科做普通病理切片，再外加免疫組化病理切片綜合進行判斷，這就是胃鏡檢查的目的。比方萎縮性胃炎和非萎縮性胃炎，有沒有腸化、有沒有潰瘍，做胃鏡病理檢查可以明確。另外一類是看有沒有惡性病變、潰瘍或者凸起病變，是癌還是淋巴瘤，還是其他的惡性病變。總之，病理檢查的主要目的是對病變性質起確定的作用。