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兒童矮小癥是否影響大腦發育要分多方面分析。引起兒童矮小癥的原因是多方面，病因非常多，比如有內分泌因素、骨發育方面因素、慢性營養障礙性疾病、染色體疾病等。以上因素分別分析是否影響大腦發育，具體分析如下： 1、垂體的生長激素分泌減少，如果只是單純影響到生長激素的分泌，多數孩子的智力是不受影響； 2、甲狀腺功能減低癥，要引起重視，因為甲狀腺激素是身體非常重要的激素之一，對于生長發育有非常重要的作用，不僅對身高增長有影響，對大腦發育也有很大影響。因此我國在孩子出生的時候會做先天性甲低的篩查，目的就是為了早期檢查到甲狀腺功能減低癥，做好防范。因為甲狀腺功能減低癥如果早期發現、早期治療，對人不會有太大影響，但是如果錯過了早期階段，會對大腦發育造成影響，會引起智力異常； 3、如果是骨關節方面的疾病，通常對智力影響不大； 4、如果是染色體疾病，比如孩子存在Turner綜合征，要看Turner綜合征的具體類型，如果正常細胞占的比例比較多，對智力不會有太大影響，如果正常細胞占的比例比較少，會對智力有少許影響。