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咽炎不會影響核酸檢測，急性或慢性咽炎均是細菌、病毒感染，或兩者混合感染導致。咽炎病原體核酸片段與需要檢測的新型冠狀病毒核酸片段不同。因此核酸檢測時即使患者有其他類型病毒或細菌感染，也不會影響檢測結果。核酸檢測若是指新冠病毒的核酸測定，通常采用咽拭子進行測量。主要根據咽部脫落黏膜中是否存在冠狀病毒的特異性成分進行檢測，從而判斷是否存在冠狀病毒感染。