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如果感染銅綠假單胞菌，早期可以在醫生指導下使用抗生素治療，一般是可以徹底清除的。但由于銅綠假單胞菌容易產生耐藥性，甚至產生廣泛耐藥，因此，需要根據醫生的建議選擇合理的抗生素進行治療。常用的藥物有很多，如妥布霉素吸入溶液，屬于氨基糖苷類抗生素，也是國內首個吸入用抗生素，可以通過抑制細菌蛋白質合成來發揮抗菌作用，對革蘭氏陰性菌（包括銅綠假單胞菌）表現出廣泛的體外抗菌活性，適用于成人伴肺部銅綠假單胞菌感染的支氣管擴張癥。或者注射用頭孢哌酮鈉舒巴坦鈉，適用于對該藥敏感的革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌以及部分厭氧菌引起的感染，對銅綠假單胞菌有較好的抗菌作用；也可以使用鹽酸左氧氟沙星，是氟喹諾酮類抗菌藥，對銅綠假單胞菌、金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌等常見病原體感染有較好的抗菌活性。此外，除了使用藥物，生活中要采取預防措施，如加強手衛生、環境清潔和消毒等，可以減少銅綠假單胞菌感染。