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常用的卵巢癌標志物有CA125和人附睪蛋白4。CA125是比較經典的卵巢癌標志物，在國際和國內很多診斷指南都有推薦。CA125在卵巢癌早期一般不會升高，在晚期升高較明顯。人附睪蛋白4是近幾年出現的一種新標志物，在卵巢癌早期即可升高，對CA125是很好的補充。 根據這兩者的結果，通過計算軟件得出羅馬指數，可以對盆腔腫塊進行風險評估。此指數越高，患卵巢癌的風險越高。其他腫瘤標志物如AFP蛋白、CEA和CA19-9在患卵巢癌時也會升高，但這些腫瘤標志物的升高不代表是得了腫瘤，還需要再根據一些其他檢查結果進行綜合判斷。