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檢查幽門螺桿菌需在空腹狀態下進行，常用檢查幽門螺桿菌的方法為碳13或碳14呼氣試驗，而呼氣試驗需患者在空腹狀態下進行。具體步驟為先進行基礎呼氣，再服用一粒含有碳13或碳14標記的尿素膠囊，在胃內作用半個小時左右進行第二次呼氣。根據呼氣中碳13或碳14標記的二氧化碳含量，判斷患者是否存在幽門螺桿菌感染。 除呼氣試驗之外，還可通過胃鏡進行檢測，在胃鏡下進行快速尿素酶，及取病理進行病理學檢測判斷是否存在幽門螺桿菌，以上兩種方式都需要在空腹狀態下進行。其它方式還包括幽門螺桿菌抗體檢查、大便中尋找幽門螺桿菌抗原，上述檢查也建議在空腹狀態下進行。