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檢查幽門螺旋桿菌是否需要空腹，與檢查方式的選擇有很大關系。如選擇碳13，或碳14的呼氣試驗，患者則需空腹進行檢查；如選擇血清抗體檢查，則無需空腹；如選擇大便抗原檢測，患者也無需空腹。血清抗體檢測陽性，僅可代表患者既往感染過幽門螺旋桿菌，不表示患者正在感染。因此一般建議選擇碳13，或碳14的呼氣試驗，如檢測結果陽性，則表示現癥感染 ，有助于后期的指導治療。