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在臨床上，血清淀粉酶常常作為急性胰腺炎診斷的首選指標。胰腺作為人體最重要的消化腺，可以分泌幾乎所有的消化酶，其中最重要的就是淀粉酶，胰腺外分泌細胞大量水腫，甚至壞死的時候，里面的淀粉酶沒有釋放到消化道起到消化的作用，而是直接進入到血液，使血清淀粉酶快速的升高。淀粉酶還可以通過腎小球濾過。在流行性腮腺炎時，特別是急性胰腺炎時，血和尿中的淀粉酶顯著性升高，急性胰腺炎發病后，8-12小時內血清的淀粉酶開始升高，12-24小時達到高峰值，2-5天下降至正常范圍，如果超過500U/L即有診斷意義，達到350U/L應該可以懷疑是急性胰腺炎這種疾病。尿淀粉酶約在發病后12-24小時開始升高，下降也比血清淀粉酶要慢，因此發病后測定尿淀粉酶更有價值。急性闌尾炎、腸梗阻、胰腺癌、膽石癥、潰瘍病穿孔以及嗎啡注射后都可以引起血淀粉酶的升高，但常常低于500U/L。