懷孕40天可以選擇藥流或手術流產，具體選擇哪種方法，需要看患者本人的體質和懷孕的時間等相關因素來選擇。
如果懷孕時間在40天到49天之間，可以選擇藥物流產，但藥物流產有可能流不干凈，如果發生這種情況，可能需要采取人工清宮手術。
如果懷孕時間超過49天，就不能選擇藥物流產了，此時應該選擇人工流產方式，也就是通過手術來終止妊娠。
總之，如果沒有懷孕的打算，同房時盡量做好避孕措施；如果需要流產，應到正規醫院在醫生的指導下選擇流產方式。
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