毛囊炎的治療藥物有多種，包括抗菌洗劑、抗生素和抗真菌藥等。
對于毛囊炎早期患者，可以配合醫生使用醋酸氯己定溶液、2%碘酊等藥物，擦拭患處，能夠抑制病原體，減輕皮膚炎癥。
如果是細菌感染引起的毛囊炎，患者可以遵醫囑選擇外用莫匹羅星軟膏、夫西地酸鈉軟膏等藥物，能夠殺滅、抑制細菌，減輕炎癥。對于細菌感染所致的毛囊炎，如果皮損較大或反復發作，還可以遵照醫囑口服頭孢呋辛酯顆粒、鹽酸多西環素腸溶膠囊等藥物，能夠減輕感染。
對于真菌感染引起的毛囊炎，患者可以根據醫囑外用硝酸咪康唑乳膏、酮康唑乳膏等藥物，可抑制真菌，減輕炎癥。對于癥狀較嚴重的真菌感染患者，還可以依照醫囑口服伊曲康唑膠囊、氟康唑膠囊等，能夠發揮殺菌作用。
具體使用哪種藥物需要根據毛囊炎的具體病因而定，建議遵醫囑用藥。
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