月經干凈后三天又來了可能是以下原因導致：
1. 子宮內膜疾病：如子宮內膜息肉、子宮內膜增生等，可能是由于內膜的異常增生導致不規則的出血。可以服用一些消炎的藥物進行治療。
2. 未完全排空：有時候在月經結束時，子宮內的血液并沒有完全排空，殘留的血液可能在幾天后排出，導致出血。
3. 卵巢功能異常：如早泄或晚排卵，導致月經周期紊亂，例假結束后不久又出現出血。
4. 宮頸問題：如宮頸炎癥、息肉或其他宮頸問題可能導致出血，即使在月經結束后也可能發生。
5. 荷爾蒙失調：荷爾蒙失調可能導致月經周期紊亂，包括例假結束后的異常出血。
建議咨詢婦科醫生進行進一步的檢查和診斷，以確定具體原因并制定合適的治療計劃。在陰道流血期間需要保持外陰衛生，禁止同房。
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