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腫瘤標志物高的臨床意義通常代表某些惡性腫瘤的存在可能，但在一些良性疾病也可以出現腫瘤標志物高，要注意鑒別。腫瘤標志物是腫瘤細胞產生并且分泌到血液或體液中，而被檢測到的蛋白質、酶類和代謝產物。當腫瘤標志物高的時候可能提示體內存在惡性腫瘤，比如甲胎蛋白增高往往提示原發性肝癌，或生殖腺來源的惡性腫瘤存在，癌胚抗原增高往往發生在肺腺癌、乳腺癌、胃癌、腸癌、胰腺癌的病人。糖類抗原CA199增高往往發生在胃癌、腸癌、胰腺癌等病人，糖類抗原CA125增高主要發生在卵巢癌、輸卵管癌、原發性腹膜癌的病人。這些腫瘤標志物升高后通常不能確診惡性腫瘤，還要通過胃腸鏡檢查以及相關的影像學檢查來發現病變，最終通過病理學檢查才能夠確診。良性疾病也會引起腫瘤標志物高，如慢性肝病中的肝炎、肝硬化。腎功能不全的病人以及慢性炎癥性疾病也可以引起腫瘤標志物高，要注意鑒別。