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HLA-B27陰性指此患者不攜帶有HLA-B27基因，同時細胞表面沒有基因表達的蛋白產物。HLA-B27指人類白細胞抗原B27，此基因屬于Ⅰ型主要組織相容復合體基因，此基因在機體所有的細胞核上都會表達，尤其是機體中淋巴細胞表面會有表達，若患者表達HLA-B27檢測陽性，與強直性脊柱炎有密切關系，在強直性脊柱炎患者中90%的患者基因表達呈陽性，而在一般人群中，HLA-B27陽性比HLA-B27陰性的人群患強直性脊柱炎的幾率要明顯增加。目前HLA-B27有很多臨床亞型，包括100多種，其中HLA-B*27:04和HLA-B*27:05與強直性脊柱炎發病有密切關系，但應注意HLA-B27陽性，并不能確診是強直性脊柱炎，而陰性也并不能夠排除強直性脊柱炎。