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Barrett食管經過多長時間發生癌變，不是能夠確定的數字。Barrett食管的癌變可能需要經過幾年、十幾年，甚至幾十年，也可能終生不會發生癌變。Barrett食管發生癌變的幾率是5%-20%，是一般人發生癌變的30-125倍。Barrett食管癌變要經過上皮化生、移行性改變，然后經過食管黏膜上皮的非典型增生發展成食管腺癌。原發性食道腺癌中50%來自于Barrett食管，所以Barrett食管是一種癌前病變，應該早期發現、早期治療，預防癌變。Barrett食管的病人應該堅持定期隨訪，每年進行胃鏡檢查，早期發現細胞的移行增生和早期癌變，給予相應的手術治療。