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丙肝病毒基因分型一般分為六種，分別為基因1型、基因2型、基因3型、基因4型、基因5型、基因6型，每個基因型又可以分為若干亞型，一般用a、b、c表示，如基因1a型、1b型、2a型、2b型等。不同地區基因型分布存在一定差異，我國最常見的基因型是基因1b型，占50%以上，其次是2a型，約占1/4，再其次是基因3型和基因6型，在吸毒人群中比較常見，而基因4型和5型在我國較罕見。 基因分型與抗病毒治療藥物和治療方案有關，抗病毒藥物分為基因特異型和泛基因型兩大類。基因特異型主要是針對基因1型和4型，泛基因型可針對所有基因型，兩大類藥物療效均較好，但價格存在較大差異。因此，一般在治療前都要進行基因型檢測，以選擇合適的藥物。