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衣原體抗體陽性提示有衣原體感染，但不能確定為當前感染。一般IgM類抗體陽性與近期初次感染有關，IgG類抗體陽性與反復再次感染有關，IgA類抗體陽性與泌尿生殖道黏膜感染有關，盡管產生抗體表示機體受到衣原體感染，但是目前臨床實驗室通常只檢測肺炎衣原體抗體IgM。對沙眼衣原體感染通常檢查分泌物中衣原體抗原和用PCR方法檢測其DNA是否存在。肺炎衣原體可引起急慢性上呼吸道感染、肺炎、心內膜炎、腦膜炎、結節性紅斑，同時可參與動脈粥樣硬化的發病。有以上癥狀的患者，若抗肺炎衣原體抗體IgM陽性，提示近期有肺炎衣原體感染，確診則需由臨床醫生根據各種檢查綜合判斷。