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臨床如果發生可疑EB病毒感染，通常需進行EB病毒抗體的IgM(免疫球蛋白M)、IgG(免疫球蛋白G)檢測。如果IgM結果為陽性，通常提示發生急性EB病毒感染，需進一步檢測血清當中的EB病毒DNA，如果檢查DNA為陽性，此時便可確診為急性EB病毒感染。對于血清DNA的檢測要求，通常無需進行全血DNA檢測，正常人的淋巴細胞內便可能潛伏EB病毒，如果檢測全血EB病毒，有可能出現假陽性表現，所以通常需進行血清的EB病毒DNA，此時如果檢查結果為陽性，便可考慮發生急性EB病毒感染。對于慢性EB病毒感染，通常IgM不會表現為陽性，IgG水平相對會顯著升高，此時提示存在慢性EB病毒活動感染，需進一步行血清EB病毒DNA檢測，檢查DNA為陽性，才能確定是慢性活動性EB病毒感染，同時還需結合患者臨床表現進行判斷。