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血紅蛋白電泳主要是針對地中海貧血疾病來進行檢查，所謂地中海貧血又叫海洋性貧血，一般是遺傳因素導致血紅蛋白里的珠蛋白鏈合成異常。珠蛋白鏈有α、β、γ不同類型。 當基因改變以后，導致某類型珠蛋白鏈發生合成障礙，在做血紅蛋白電泳時，會發現α、β或γ哪個類型的合成降低、缺失。 對于判斷地中海貧血的類型，根據缺失多少可以決定疾病嚴重程度，所以血紅蛋白電泳往往只是針對地中海貧血患者來進行檢查。 地中海貧血患者主要在我國廣東、廣西、四川有比較多的發病率，在長江以南也有散在病例，在北方相對比較少見。