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腸鏡活檢意味著醫生需要對可疑的病變進行判別，醫生在給患者做結腸鏡檢查時，需要了解腸鏡下發生的是否為病變以及類型、程度，經過治療后病變有無恢復或痊愈，需要進行活檢以了解上述信息。有時還需了解病變的范圍、程度，病變是由何類型細菌或感染原所造成，此時需要通過活檢采取一定的標本，再進行后續的處理。后續的處理包括要對所采取的標本進行固定，對采取的標本進行切片、病理學的檢查，甚至需要進行免疫組化的檢查。通過上述檢查，有助于了解是否發生病變以及病變程度，是淋巴細胞浸潤還是中性粒細胞浸潤，有助于判別是慢性病變還是急性疾病，有無嗜酸細胞浸潤，有助于判別是否為過敏性疾病等，所以活檢對于腸鏡檢查可以起到精確診斷的作用。