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肺部出現衣原體感染后，可以引起衣原體肺炎。但通常患者不進行肺炎衣原體的培養，因其陰性情況較常見，原因如下： 1、進行培養時痰液留取不合格； 2、肺炎衣原體在培養時操作流程特別復雜，培養時間也較長，所以陰性率比較高，此為最主要的原因。 而診斷肺炎衣原體感染主要是通過衣原體抗體檢測，即初期抗原抗體和恢復期抗體，一般14天左右時滴度出現四倍以上增高才可診斷衣原體感染。衣原體抗體包括IgM和IgG，即急性期時主要檢查IgM，如果發現IgM陽性，同時有肺炎衣原體感染后的表現，會診斷為肺炎衣原體感染。