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如果是消化道腫瘤，如胃癌、腸癌，磁共振檢查可能比胃鏡、腸鏡檢查效果稍差。磁共振也稱磁共振成像、MRI，是臨床上通過磁共振顯像應用于臨床檢查人體組織結構，觀察是否有異常組織結構成分存在。磁共振成像可以用于身體多個部位，如四肢、軀干、頭部、頸部，對于實質性腫塊敏感度較高，準確性較高，如肝臟、腎臟的腫塊，用磁共振檢查比較容易做出精準判斷。磁共振成像沒有射線，因為其利用磁共振的方式進行成像，CT檢查有X射線，磁共振對人體危害更小，磁共振成像信息量較大，能夠幫助診斷的信息比較多，更有助于做出精準判斷。磁共振除能夠用在診斷，還能用在治療效果的判定，如在治療前做磁共振掃描，在治療以后再重復做磁共振掃描，觀察腫塊是否被殺死，活性是否減弱、縮小。