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PET-MR檢查只是對掌握腫瘤情況有幫助的一種輔助檢查，但不是癌癥診斷的金標準，確診癌癥需要經過病理診斷。 PET-MR是一種新型影像學檢查手段，精度較高，范圍較廣，較X光、CT安全，可以明確腫瘤定位、定量、定性、分期、敏感性。常常用來判斷腫瘤性質、是否適合手術、放化療效果、有無轉移復發等，方便醫生評價療效，調整治療方案。 PET-MR檢查對于發現1mm左右的癌癥有很大幫助，但是也有很大缺點，比如部分癌細胞無法拒絕脫氧葡萄糖核酸，即18F-FDG。因而正常細胞如果和癌細胞重疊，容易得到錯誤診斷，所以不能夠過分依賴于PET-MR。