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咽喉炎對核酸檢測不會有影響，引起咽喉炎的病原菌大部分是流感嗜血桿菌、肺炎球菌、乙型溶血性鏈球菌等。目前核酸檢測主要是針對新型冠狀病毒，而新型冠狀病毒的基因序列與咽喉炎的病原菌有很大區別。因此無論是做咽拭子還是做鼻拭子，都只針對新型冠狀病毒進行檢測，不檢測引起咽喉炎的其他病原菌。只要鼻拭子和咽拭子的分泌物中沒有新型冠狀病毒，不論是何種病原菌引起的咽喉炎，都無法檢測出，對核酸結果也不會產生影響。如果患有咽喉炎的患者，在這段時間有新型冠狀病毒的接觸史，可能成為無癥狀感染者，患者進行核酸檢測時，咽拭子或者鼻拭子的核酸結果可能呈陽性。此時并不是由于咽喉炎對核酸結果產生影響，而本身感染新型冠狀病毒導致檢測呈陽性。