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通過足跟血檢測的疾病不一樣，如新生兒疾病篩查的三種疾病，即苯丙酮尿癥、呆小癥和蠶豆病，每一項疾病的使用方法各不相同，如先天性甲狀腺功能低下癥使用方法是時間分辨免疫熒光檢測，而蠶豆病和苯丙酮尿癥使用的是熒光分析法，而且部分地方使用足跟干血片進行耳聾基因檢測。 目前通過足跟血還進行新生兒多種遺傳性代謝性疾病的檢測，通過物質質量和電荷之間的比值對物質進行區分，使用的是質譜法，目前對足跟血的檢測方法主要是集中在三類，即時間分辨免疫熒光檢測技術、熒光分析法、質譜法。