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強直性脊柱炎病因及發病機較復雜，目前認為重要原因主要分以下方面：1、遺傳背景：通過對家系及同卵雙生子的研究發現，強直性脊柱炎與遺傳密切相關，部分以家族性發病，但并非100%遺傳給下一代，但發生幾率則相對較大。常見基因為HLA-B27基因，亦存在部分非HLA-B27基因相關，臨床亦可見部分HLA-B27陰性的強直性脊柱炎患者；2、環境因素：細菌感染，如肺炎克雷伯桿菌感染或腸道部分微生物感染，可通過分子模擬機制誘發強直性脊柱炎發病。環境因素與遺傳背景因素綜合作用可引起體內免疫紊亂，誘發T細胞與B細胞過度活化，可產生自身反應性T細胞存在，可引起組織損傷，導致疾病發生。