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細菌感染是由鏈球菌、葡萄球菌、流感嗜血桿菌等侵犯人體所引起的感染，病毒感染常見的是由腸病毒、腺病毒、流感病毒等各種病毒侵犯人體而引起的感染。病毒感染與細菌感染通常都有發熱的癥狀，病毒感染多為持續性高熱，退熱藥的效果較好，而細菌性發熱體溫波動比較大，且伴有寒戰，退熱效果往往比較差，不易徹底治療。病毒性感染會伴隨流鼻涕、咳嗽、少痰，也可以伴有皮疹。而細菌性感染多有流膿鼻涕，咳痰多為黃膿痰，且較少出現皮疹。病毒性感染通常白細胞總數正常或偏低，中性粒細胞比例偏低，淋巴細胞比例偏高。而細菌感染白細胞總數升高，中性粒細胞比例也明顯升高。進行病原學檢查可以看到細菌，而細菌的培養是在臨床上區分細菌感染和病毒感染最可靠的方法。