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系統性紅斑狼瘡是一種以致病性的自身抗體，以及免疫復合物形成并介導的多臟器受累的慢性自身免疫性疾病，目前發病機制以及病因并不非常明確，但是從總體上而言，通過多方面的臨床研究，發現系統性紅斑狼瘡的發病，遺傳因素起了一定的作用。有資料研究表明，系統性紅斑狼瘡患者的第一代親屬中，系統性紅斑狼瘡患者的發病人數是正常人群的8倍以上。在臨床上，系統性紅斑狼瘡患者的家族中，也常常會有其他免疫性疾病，如類風濕、干燥綜合征等親屬存在。并且多年的研究已經證明系統性紅斑狼瘡是多基因相關的疾病，與許多的人類白細胞抗原的缺陷有關。推測系統性紅斑狼瘡是由多個基因，在某些條件下相互作用，改變了機體的免疫耐受狀態而導致疾病發生。系統性紅斑狼瘡的發病是由很多的易感基因相互作用疊加產生，現在已經發現，相關的基因只能解釋大概15%的遺傳的可能性。環境因素也在系統性紅斑狼瘡的發病中，起非常重要的作用。