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灰質異位指在胚胎發育過程中神經元遷移異常，不能遷移到大腦表面的正常部位，就稱為灰質異位。神經元應該是從腦室周圍的室管膜下開始遷移，但是由于遷移的過程中出現滯留或聚集在室管膜下，就會形成異常的神經元，而導致異常的放電。這種情況會引起癲癇，其有70%-80%的概率。如果癲癇發作時期較早，還會導致認知以及智力、語言等功能的障礙。如果灰質異位范圍較小，且癲癇發作年齡比較晚，可能對智力影響就會比較小。這種情況可以發生在大腦的任何部位，也可以伴隨其它大腦畸形一同存在，如腦裂畸形、先天性巨腦回或者無腦回等，核磁共振檢查能清晰的顯示異位灰質的位置及形態的異常表現。