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顱內感染的抗生素，需要結合致病菌來進行選擇，所以在顱內感染發生的時候，會給病人進行腰穿留取腦脊液，進行病原微生物的培養，最終抗生素的選擇根據病原微生物的類型，還有藥敏試驗來選擇敏感的抗生素。在藥敏試驗沒有出來之前，可能會對腦脊液，進行涂片，區分是革蘭氏陽性還是革蘭氏陰性細菌的感染，來經驗性的選擇一些抗生素，具體如下：1、細菌感染引起的顱內感染：選擇的抗生素有三代頭孢類，并且能夠通過血-腦屏障，如頭孢曲松、頭孢唑肟等這些抗生素來治療顱內的感染；2、結核桿菌引起的顱內感染：這個時候，就需要選擇聯合應用一些抗結核的藥物，比如異煙肼、利福平等來治療結核性腦炎；3、真菌感染引起的顱內感染：如隱球菌感染，這樣的情況下，可能需要選用一些治療真菌的藥物，比如制霉菌素B等來進行顱內感染的治療。