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甲胎蛋白偏低在臨床上無過多意義，通常不會進行任何處理。甲胎蛋白是胎兒在母體體內產生的特異性蛋白，在胎兒出生2周左右，數值較高。而胎兒出生2周以后，數值降低，甚至可能無法測出，即甲胎蛋白偏低。甲胎蛋白升高常見于肝炎活動期，由于肝細胞受到損傷，血清中的甲胎蛋白可以有所升高。此外，畸胎瘤也可引起甲胎蛋白升高。而患有原發性肝細胞肝癌的患者，甲胎蛋白也可以處于高值水平，但并非肝癌病人均會出現甲胎蛋白升高，出現甲胎蛋白升高的概率為70％-80％。