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志賀菌主要引起的疾病有以下幾種：1、細菌性痢疾：可以引起普通型的細菌性痢疾，主要表現為高熱，伴有腹痛、腹瀉、排黏液膿血便。可以出現全身的感染中毒癥狀，畏寒、寒戰、頭疼，全身關節、肌肉酸痛，全身乏力，一般排便次數比較多。由于志賀桿菌侵犯的部位主要是在直腸和乙狀結腸，所以患者始終會有排便的感覺，排便次數比較多，但每次排便的量比較少，只是一些局部炎癥的滲出物，糞質相對比較少，可以出現左下腹壓痛；2、中毒型痢疾：普通型的痢疾相對比較多見，但也有極少一部分患者，會出現中毒型的痢疾，尤其會見于比較健康的兒童。可能是由于過敏，或者其他的機制引起，到目前為止，中毒型痢疾發病的機制不是非常清楚，但主要的致病物質是內毒素。可以引起全身的感染中毒癥狀加重，出現低血壓休克，或者出現中毒性腦病；3、慢性菌痢：細菌性痢疾如果治療不及時，或者病情遷延，可以引起慢性菌痢。尤其是福氏桿菌引起的痢疾，可以出現慢性菌痢。如果病程超過2個月，考慮為慢性菌痢；4、溶血尿毒綜合征：志賀桿菌可以產生外毒素，極少一部分患者可以引起溶血尿毒綜合征，但相對幾率不是非常高。