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人體或者環境中的細菌，主要根據革蘭染色分為革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌。革蘭氏陽性菌，在人體的體表或者環境中都可以見到。一般來說，革蘭氏陽性桿菌的致病性少，條件致病性或者非致病性的相對較多。腸道里大多數革蘭氏陽性桿菌是厭氧菌，酸奶里面的細菌也是革蘭氏陽性桿菌，跟革蘭陰性桿菌有區別。患者在醫院里發生感染后，經常會培養到革蘭氏陰性桿菌，像大腸埃希菌、銅綠假單胞菌、鮑曼不動桿菌，其都是革蘭氏陰性菌。厭氧菌，如艱難梭菌或者其他芽孢桿菌都是革蘭氏陽性桿菌。