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患者進行幽門螺桿菌碳13呼氣試驗，判定有無現癥感染的情況，正常值一般是0-3.9，檢測結果判定為陰性，若超過3.9，判定結果為陽性。但幽門螺桿菌碳13的呼氣試驗，會受到患者服藥的影響，亦會存在假陽性，以及假陰性的可能。如近期服用質子泵抑制劑類藥物，因胃腸炎或牙疼服用消炎藥，均會影響碳13的檢測結果。因此一般建議患者根除幽門螺桿菌治療，結束之后，停藥1個月以上的時間，再復查碳13的呼氣試驗。若患者服用質子泵抑制劑或消炎的藥物，要停藥至少2-4周以上再復查，使碳13的檢測更加準確。另外進行幽門螺桿菌碳13檢測時，要空腹的狀態。