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角膜刮片發現存在菌絲，說明為真菌性角膜炎，即角膜炎由真菌感染造成，能幫助臨床醫生確定病因。角膜刮片發現發現菌絲的臨床檢驗非常簡單有效，對真菌性角膜炎的陽性率及確診率達到95%以上，比共焦顯微鏡發現菌絲陽性率高，共焦顯微鏡發現菌絲陽性率維持在30%，甚至<30%。真菌性角膜炎典型的臨床特點是癥征分離，即癥狀和體征二者相互分離的現象。臨床醫生通常可以發現患者存在嚴重體征即角膜潰瘍，存在圓形的白色潰瘍灶，甚至有黏稠的前房積膿、角膜潰瘍穿孔，但患者疼痛、畏光或流淚等臨床癥狀不嚴重。真菌性角膜炎另一個特點是秋收夏忙時，農民在收莊稼時植物劃傷角膜，此時容易發生真菌性角膜炎。