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幽門螺桿菌檢測設定了一個標準，當檢測出的細菌數量超過標準被認定為陽性，即為感染。當檢測出的細菌數量低于標準的時候，被認為幽門螺桿菌陰性。幽門螺桿菌數量沒有絕對的零，只是每個人體內細菌的數量多少不同，并且根據檢測標準不同，可能標準值不同。 幽門螺桿菌檢測方法較多，例如進行呼氣試驗的時候，有C13呼氣試驗和C14呼氣試驗，二者檢驗標準值不同。因此，不能認定幽門螺桿菌數量有多少，只能說明幽門螺桿菌感染是陽性還是陰性。