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肝癌的經典標志物不在肝功能化驗指標中，其經典標志物是甲胎蛋白、癌胚抗原、CA19-9，以及γ-谷氨酰轉肽酶同工酶。上述指標都與肝癌有聯系，但其中最主要的肝癌標志物是甲胎蛋白，英文縮寫為AFP。經典傳統的肝功能檢查中，包括白蛋白、總蛋白，以及轉氨酶，即谷丙轉氨酶和谷草轉氨酶，以及膽紅素，上述指標與肝癌沒有明顯的關聯性。白蛋白反映肝臟合成蛋白質的功能，轉氨酶主要體現肝臟炎癥活動程度，膽紅素反映肝臟儲備功能。肝臟功能越差，膽紅素越高，如果發生肝功能衰竭，膽紅素水平處于較高的范圍，但上述指標通常與肝癌沒有明顯聯系。肝癌的診斷除參考肝癌標志物外，更重要的是要有影像學依據，包括超聲、CT、核磁。如果從肝臟里面找到占位性病變，同時患者肝癌標志物升高，非常有助于肝癌的診斷。