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幽門螺桿菌感染在徹底根除以后，實際上真正的復發率并不高。現在進行很多臨床感染以后病人的再隨訪、再觀察顯示，在國家人群感染背景相對比較高的狀態下，幽門螺桿菌在根除以后，年再復發率只有4%-5%。感染根除了以后，1年大概有4%-5%的病人會出現復發。但是累計復發率臨床還需要重視，隨著年的增加，過了5年以后可能復發率會有百分之十幾。 所以根除幽門螺桿菌只要沒有禁忌癥的情況下，要盡量發現幽門螺桿菌感染，盡量根除，這也是減少人群里面幽門螺桿菌感染的基數，減少人群之間交叉感染，也會降低復發率。另外，在臨床見到幽門螺桿菌根除以后，很短期病人又復發，這時不是幽門螺桿菌復發，而是幽門螺桿菌并沒有根除，可能當時只是假陰性的結果。