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尿道感染是細菌定植于膀胱的過程，一般情況下是肛門來的革蘭氏陰性桿菌，當然也有5%-10%的革蘭氏陽性球菌，通過定植的方式，通過陰道、尿道的方式，從尿道逆行到膀胱感染。偶爾有性傳播疾病，如淋病或非淋菌性尿道炎，是一種特殊尿道感染，是尿道球腺的感染，也是這些致病微生物通過上行尿道口的方式逆行感染。 細菌在進入人體尿道進入膀胱之后，先進入膀胱黏膜上皮，偶爾會形成儲菌庫，暫時不感染，在免疫功能低下或憋尿的情況下進一步感染。進入膀胱黏膜上皮的細菌，會利用膀胱黏膜上皮細胞里的有氧物質進行自身繁殖，在繁殖到一定程度之后，會進入膀胱腔內，再進一步感染其他細胞。感染的概念是病原微生物、外來生物進入人體的體細胞。